Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP6Q5VW22 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms