Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms