Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOGA3Q5TF21 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms