Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NHSL1Q5SYE7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms