Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms