Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAP1Q5SW96 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms