Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PERM1Q5SV97 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms