Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TDRD12Q587J7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms