Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL22Q53GT1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms