Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HSD17B12Q53GQ0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms