Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms