Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP100Q494V2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP100Q494V2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms