Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms