Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC27Q2M243 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms