Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MSMPQ1L6U9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MSMPQ1L6U9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms