Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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