Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTF1Q16619 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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