Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CARTPTQ16568 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms