Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SNAPC1Q16533 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms