Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNXAQ16473 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms