Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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