Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA4Q16363 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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