Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTRK3Q16288 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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