Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN9AQ15858 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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