Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCOA1Q15788 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA1Q15788 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
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