Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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SYCP1Q15431 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP1Q15431 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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