Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NR6A1Q15406 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms