Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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