Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPAQ15257 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPAQ15257 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms