Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HDM1Q15032 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms