Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms