Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ODF1Q14990 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms