Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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GPNMBQ14956 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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GPNMBQ14956 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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GPNMBQ14956 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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