Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE4AQ14139 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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