Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCINQ13939 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCINQ13939 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCINQ13939 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCINQ13939 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCINQ13939 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCINQ13939 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCINQ13939 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms