Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF2H3Q13889 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H3Q13889 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms