Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNTB1Q13884 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms