Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXOSC2Q13868 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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