Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAMC2Q13753 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMC2Q13753 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMC2Q13753 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMC2Q13753 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMC2Q13753 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LAMC2Q13753 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LAMC2Q13753 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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