Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSTA3Q13630 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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TSTA3Q13630 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TSTA3Q13630 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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