Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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MKRN4PQ13434 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MKRN4PQ13434 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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