Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP3B2Q13367 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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