Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KLF1Q13351 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms