Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
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