Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RESTQ13127 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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RESTQ13127 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RESTQ13127 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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RESTQ13127 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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RESTQ13127 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RESTQ13127 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RESTQ13127 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RESTQ13127 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RESTQ13127 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RESTQ13127 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RESTQ13127 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RESTQ13127 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RESTQ13127 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RESTQ13127 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RESTQ13127 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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RESTQ13127 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RESTQ13127 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RESTQ13127 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RESTQ13127 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RESTQ13127 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RESTQ13127 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RESTQ13127 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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