Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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