Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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