Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3Q12983 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3Q12983 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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