Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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FOXC1Q12948 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXC1Q12948 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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