Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF2Q12933 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF2Q12933 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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